Film "28 Weeks Later..." mengisahkan enam bulan setelah wabah virus berhasil dimusnahkan, pasukan AS mengumumkan bahwa perang terhadap infeksi telah berhasil dimenangkan dan rekonstruksi negara dapat kembali dilakukan. Namun, situasi yang aman ini tidaklah sepenuhnya aman. Di gelombang pertama kembalinya para pengungsi untuk bersatu dengan keluarganya, ada seseorang yang menyimpan rahasia kelam. Virus tersebut ternyata belum sepenuhnya musnah dan kali ini virus itu akan menjadi lebih berbahaya dari sebelumnya.